chemodiversity/TODO.md

Vor Auswertung

• Baum der Chemikalien so in der Natur möglich?
  • Gesetze in der Natur?
  • Recherche, wie solche Bäume aussehen
• Startexpression eines neu eingeführten Gens bei 0.5?

Auswertung

Ermittelte Metriken

• C_#: Durchschnittliche Menge an produzierten Stoffen
• C_\mu: Durchschnittliche Anzahl produzierter Komponenten
• C_\sigma: Zusätzlich: Betrachtung der Varianz dieser Komponenten innerhalb der Population
  (Z.B. Stoff A wird immer mit 0.5 produziert, hat also keine Varianz, wogegen Stoff B im Schnitt mit 0.5 produziert wird, aber dies eine extreme Varianz auslöst)
• C_d: Durchschnittliche Anzahl distinkter Produzierter Stoffe (sprich nicht-endemisch, C_\sigma > \epsilon)
• \mathbf{E}[C_{plant} - C_#]: Durchschnittliche Abweichung der produzierten Stoffe gegenüber dem Schnitt der Gesamtpopulation
• Anteile der Stoffe, die giftig sind
• #Plants die Angreifer X abwehren könnten

Messung

• Ermitteln der Metriken für alle x Generationen
• Stabilisieren sich die Metriken bei identischem Aufbau konsistent?
  • Ja, \pm Random-Effekt

Zu untersuchende Parameter

• Attackrate Herbivoren
• Fixkosten Enzyme
• Kosten Einbußen im PPM
• Automimicry ja/nein
• Angreifer zufällig ja/nein